生物化學和分子生物學上的差別，可以將二者區(qū)別開來。細胞凋亡的檢測方法有很多，下面介紹幾種常用的測定方法。
　　
　　一、細胞凋亡的形態(tài)學檢測
　　
　　根據凋亡細胞固有的形態(tài)特征，人們已經設計了許多不同的細胞凋亡形態(tài)學檢測方法。
　　
　　1光學顯微鏡和倒置顯微鏡
　　
　?。?）未染色細胞：凋亡細胞的體積變小、變形，細胞膜完整但出現發(fā)泡現象，細胞凋亡晚期可見凋亡小體。
　　
　　貼壁細胞出現皺縮、變圓、脫落。
　　
　?。?）染色細胞：常用姬姆薩染色、瑞氏染色等。凋亡細胞的染色質濃縮、邊緣化，核膜裂解、染色質分割
　　
　　成塊狀和凋亡小體等典型的凋亡形態(tài)。
　　
　　2熒光顯微鏡和共聚焦激光掃描顯微鏡
　　
　　一般以細胞核染色質的形態(tài)學改變?yōu)橹笜藖碓u判細胞凋亡的進展情況。
　　
　　常用的DNA特異性染料有：HO33342(Hoechst33342)，HO33258(Hoechst33258),DAPI。三種染料與DNA的結合是非嵌入式的，主要結合在DNA的A-T堿基區(qū)。紫外光激發(fā)時發(fā)射明亮的藍色熒光。
　　
　　Hoechst是與DNA特異結合的活性染料，儲存液用蒸餾水配成1mg/ml的濃度，使用時用PBS稀釋成終濃度為2~5mg/ml。
　　
　　DAPI為半通透性，用于常規(guī)固定細胞的染色。儲存液用蒸餾水配成1mg/ml的濃度，使用終濃度一般為0.5~1mg/ml。
　　
　　結果評判：細胞凋亡過程中細胞核染色質的形態(tài)學改變分為三期：Ⅰ期的細胞核呈波紋狀（rippled）或呈折縫樣（creased），部分染色質出現濃縮狀態(tài)；Ⅱa期細胞核的染色質高度凝聚、邊緣化；Ⅱb期的細胞核裂解為碎塊，產生凋亡小體。